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基于叶绿体基因的不同分子性状重建蕨类植物系统发育的研究

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基于叶绿体基因的不同分子性状重建蕨类植物系统发育的研究
论文目录
 
摘要第1-5页
abstract第5-10页
1 前言第10-20页
 1.1 叶绿体基因组第10-14页
  1.1.1 叶绿体基因组的基本结构第10-11页
  1.1.2 叶绿体基因组的基因组成第11-14页
  1.1.3 叶绿体基因组的研究进展第14页
 1.2 分子进化及系统发育研究方法第14-17页
  1.2.1 分子进化的动力第14-15页
  1.2.2 密码子变异速率第15页
  1.2.3 最大似然法第15-16页
  1.2.4 最大简约法第16页
  1.2.5 贝叶斯法第16页
  1.2.6 邻接法第16-17页
 1.3 蕨类植物系统发育研究现状第17-18页
 1.4 本研究的目的和意义第18-20页
2 材料与方法第20-31页
 2.1 序列数据第20页
 2.2 分析方法第20-31页
3 结果第31-56页
 3.1 采用四种构树方法重建系统发育第31-33页
  3.1.1 基于串联的基因序列数据集重建系统发育第31-32页
  3.1.2 基于碱基替换数据集重建系统发育第32页
  3.1.3 基于插入/缺失数据集重建系统发育第32页
  3.1.4 基于密码子第二位碱基数据集重建系统发育第32-33页
  3.1.5 基于密码子第三位碱基数据集重建系统发育第33页
 3.2 对比分析由不同分子性状数据集构建的进化树第33-56页
  3.2.1 基于不同分子性状构建最大似然树第33-34页
  3.2.2 基于不同分子性状数据集构建最大简约树第34页
  3.2.3 基于不同分子性状数据集构建贝叶斯树第34-35页
  3.2.4 基于不同分子性状数据集构建邻接树第35-56页
4 讨论与结论第56-59页
 4.1 讨论第56-58页
  4.1.1 四种构树方法显示出的各自特点第56-57页
  4.1.2 不同分子性状对构树产生的效应第57-58页
 4.2 结论第58-59页
致谢第59-60页
参考文献第60-65页
附录第65-89页
待发表的文章第89页

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